Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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