Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms