Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms