Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF879B4DU55 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF879B4DU55 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF879B4DU55 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF879B4DU55 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF879B4DU55 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF879B4DU55 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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