Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms