Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms