Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms