Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms