Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms