Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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