Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms