Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBNO2Q9Y2G9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms