Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCG2Q9UNQ0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms