Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms