Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms