Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms