Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms