Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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