Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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