Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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