Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms