Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms