Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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