Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms