Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD4Q96M96 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms