Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms