Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC1Q96C34 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms