Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCSTNQ92542 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms