Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF128Q8TEB7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF128Q8TEB7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms