Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms