Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms