Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP43Q70EL4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP43Q70EL4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP43Q70EL4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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