Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RWDD4Q6NW29 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms