Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms