Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms