Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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