Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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