Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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