Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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