Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RPE65Q16518 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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