Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms