Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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