Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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