Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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