Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms