Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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