Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CLN3Q13286 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CLN3Q13286 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CLN3Q13286 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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