Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD2Q13200 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms