Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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