Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms